59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0233 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  42.28 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 301 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  49.33 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  35.64 
 
 		 193 aa  85.1  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 297 aa  81.6  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  40.22 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  39.13 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  42.03 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  38.04 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  38.04 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  38.04 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  36.49 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  29.73 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 296 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  35.71 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.26 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  40.91 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  36.23 
 
 		 345 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  24.86 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  38.46 
 
 		 374 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  31.43 
 
 		 566 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  36.92 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  32.05 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  36.92 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  36.92 
 
 		 376 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30.25 
 
 		 436 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  29.73 
 
 		 374 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  24.66 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  33.8 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  24.49 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  31.51 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  33.87 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  32.84 
 
 		 360 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  39.34 
 
 		 314 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 339 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 334 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>