52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1693 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1693  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0984766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 298 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  45.78 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  34.51 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 297 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  32.03 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.22 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  32.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.22 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  34.13 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  29.69 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  29.69 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  40 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  32.03 
 
 		 308 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  29.5 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  35.05 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 312 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  31.09 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  39.66 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  32.86 
 
 		 266 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  20.67 
 
 		 566 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  36.07 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  26.59 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 277 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  33.8 
 
 		 266 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  30.99 
 
 		 333 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.88 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  30.43 
 
 		 436 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 369 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 342 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  35.53 
 
 		 280 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 249 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  25.35 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  42.11 
 
 		 281 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 334 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>