15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0618 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2366  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  31.52 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  35.23 
 
 		 130 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0233  hypothetical protein  32.05 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  41.67 
 
 		 342 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>