20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0597 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3673  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1943  hypothetical protein  35.78 
 
 		 342 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.931712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  36.11 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  27.69 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  32.65 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  32.73 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  30.39 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  30.3 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  29.09 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  29.09 
 
 		 341 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  31.13 
 
 		 397 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  28.83 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  29.73 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  29.25 
 
 		 395 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  28.68 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  30.97 
 
 		 342 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  29.81 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  26.26 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>