16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3673 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3673  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1943  hypothetical protein  35.51 
 
 
342 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.931712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  29.25 
 
 
290 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  32.14 
 
 
340 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  31.25 
 
 
340 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  25.37 
 
 
130 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  22.73 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  22.73 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  22.73 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  26.32 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0618  hypothetical protein  29.59 
 
 
305 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  24.24 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>