115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1871 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1871  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  45.99 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  44.22 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  39.23 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1423  hypothetical protein  35.88 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.41572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  37.29 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2869  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  64.38 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1169  hypothetical protein  51.11 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1089  hypothetical protein  51.11 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.65 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5020  hypothetical protein  43.11 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  26.28 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  26.28 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.37 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  27.39 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.77 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  22.85 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  42.25 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  43.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  24.12 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.24 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  24.91 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  24.91 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  23.05 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  25.26 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  25.26 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  30.69 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  24.2 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1903  heat shock protein DnaJ-like  40 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  28.1 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  29.17 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1976  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2061  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  34.72 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.18 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  24.24 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  30.99 
 
 		 441 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  23.94 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  31.25 
 
 		 163 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  26.45 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  39.71 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  31.45 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  22.02 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  39.71 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  39.71 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  27.52 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  39.71 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05131  hypothetical protein  34.52 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.607741  normal  0.357471 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  39.71 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  39.71 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  39.71 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  39.71 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  43.08 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  36.62 
 
 		 448 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  21.65 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14511  hypothetical protein  36.76 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  21.8 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  30.77 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  22.71 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 469 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  29.33 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  27.78 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  22.71 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  23.84 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  21.6 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  30.68 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>