More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0759 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
270 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  33.18 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  29.96 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
301 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.92 
 
 
304 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 
302 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
293 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
293 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.42 
 
 
308 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
301 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
297 aa  102  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.12 
 
 
290 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 
311 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
278 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
288 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
290 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
270 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 
519 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  31.39 
 
 
309 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 
473 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  31.56 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
370 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.66 
 
 
278 aa  99  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
275 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  30.57 
 
 
295 aa  98.6  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
333 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
294 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.21 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.22 
 
 
343 aa  95.9  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.66 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  33.17 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  33.66 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
296 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.6 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.92 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  30.74 
 
 
272 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 
295 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
295 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  32.61 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  32.61 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
284 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  25.6 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
308 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  30.12 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  30.45 
 
 
280 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.69 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  28.51 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2221  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.13 
 
 
441 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1412  hypothetical protein  30.56 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2024  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  30.65 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
287 aa  85.1  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  25.19 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  32.45 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  26.99 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  31.41 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  30.86 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0073  ParaA family ATPase  26.94 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  32.96 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.31 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.09 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  30.29 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>