More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3238 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3238  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
316 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1975  ATP-binding protein  38.52 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2060  ATP-binding protein  38.52 
 
 
330 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1904  ATP-binding protein  38.52 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1955  ATP-binding protein  32.82 
 
 
328 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  31.44 
 
 
511 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0363  ATP-binding protein  32.74 
 
 
380 aa  154  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1397  flagellar synthesis regulator FleN, putative  25.59 
 
 
388 aa  123  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0750  ATP-binding protein  29.43 
 
 
323 aa  122  8e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.53 
 
 
271 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.97 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.67 
 
 
288 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.28 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 
271 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  22.95 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  25.51 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.34 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  32.06 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  23.53 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  24.66 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  26.21 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  31.4 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.76 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  30.86 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.39 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0073  ParaA family ATPase  33.14 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  33.14 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  33.14 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.62 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.62 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  24.41 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  24.41 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  32.34 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 
519 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  32.54 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  22.3 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  29.61 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.69 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.71 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  33.76 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  32.48 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  30.38 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  31.69 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  34.18 
 
 
265 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  30.67 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.53 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0234  conserved hypothetical protein, ATPase, ParA family  29.68 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  31.92 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  22.34 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  31.43 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2024  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.48 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0704  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.25 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.58 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  30.82 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  29.81 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  30.92 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.61 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  32.69 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  32.62 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  32.05 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>