72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2983 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1862  hypothetical protein  88.8 
 
 		 399 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1629  hypothetical protein  99.73 
 
 		 404 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2983  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  55.03 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  50 
 
 		 405 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  45.77 
 
 		 491 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  48.47 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.24 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  36.23 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  32.31 
 
 		 280 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  24.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  32.84 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  22.78 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  24.02 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  25.34 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  34.72 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  28.26 
 
 		 331 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  30.77 
 
 		 566 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  35 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  45 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  45 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  28 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 279 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  45 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 334 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  30.88 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  45 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  45 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  30.88 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  23.55 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  39.13 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  33.85 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  24.63 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  29.23 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  43.33 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  27.34 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  32.35 
 
 		 281 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  33.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 501 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.82 
 
 		 338 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  23.4 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  35.85 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.88 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 273 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  31.82 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0541  hypothetical protein  44.07 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>