50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3718 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  44.66 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  46.67 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  36.63 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  36.73 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  41.86 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  38.82 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  37.37 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  31.09 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  31.68 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  43.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  35.11 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2178  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  35.21 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  36.05 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  37.68 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>