33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2503 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  80 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  78.18 
 
 		 111 aa  163  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  79.75 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  62.38 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  37.76 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  41.94 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  37.62 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  39.56 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  38.82 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  41.25 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  37.36 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>