31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5217 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  41.9 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  39.58 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  38.64 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  32.81 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  36.23 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>