40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2230 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  247  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  57.55 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  48.51 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  43.43 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  44.21 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  40.38 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  45.26 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  45.56 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  37.33 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  35.05 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  34.52 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  43.08 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  43.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  44 
 
 		 516 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 99 aa  40  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 164 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>