38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4943 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  213  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  58.88 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  45.92 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  44.21 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  41.86 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  41.84 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  40.82 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  42 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  44.68 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  33.67 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  34.91 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  34.78 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  36.71 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  38.33 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  31.76 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>