35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0860 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 101 aa  200  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  52.53 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  42.17 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  47.22 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  52.24 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  38.38 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  45.78 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  32.67 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  32.53 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  36.92 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  41.27 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>