39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5342 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  47.57 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  45.74 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  38.27 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  36.47 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  31.73 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  34.82 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  34.04 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  32.1 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  35.29 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 126 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.92 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 186 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>