52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0225 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  78.38 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  78.18 
 
 		 109 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  69.72 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  67.27 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  77.63 
 
 		 79 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  69.39 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  44.21 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  47.31 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  43.81 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  45.36 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  40.86 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  41.25 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  42.86 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  47.3 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  45.68 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  42.39 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  40.85 
 
 		 516 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>