37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4199 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  44.21 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  43.53 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  40.86 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  47.25 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  37.62 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  42.05 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  36.67 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  34.18 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  40.8  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2812  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.14 
 
 		 338 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  29.63 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  40  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 77 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>