41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0227 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  53.7 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  36.54 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  34.86 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  45.24 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  34.74 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  36.59 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  38.81 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  35.23 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  35.21 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  32.29 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  33.82 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>