44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0677 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  71.06 
 
 		 258 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 228 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 216 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  43.24 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  43.24 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 112 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 		 135 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 117 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 157 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 110 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 99 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 95 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3066  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.870694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 77 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  40.82 
 
 		 91 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 111 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 112 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 218 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 112 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  33.77 
 
 		 100 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  35.44 
 
 		 111 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 114 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 75 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 230 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 104 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 91 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>