49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6229 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  53.27 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  46.6 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  47.47 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  40.82 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  37.96 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  37.76 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  44.57 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  41 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  36.9 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  38.46 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  37.8 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  35.05 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  33.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 513 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 346 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  27.66 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  22.22 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  41.18 
 
 		 516 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 		 508 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  35.21 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  28.95 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 112 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1055  Xre family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>