198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7007 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 110 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  90 
 
 		 125 aa  203  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  55.45 
 
 		 112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  50.62 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  40 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  40 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  40 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  40.3 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 505 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  35 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  35 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  37.29 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  36.54 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  42.55 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0807  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 528 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>