59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0180 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  95.54 
 
 		 112 aa  216  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  93.75 
 
 		 112 aa  214  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  82.14 
 
 		 112 aa  180  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  80.36 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  55.45 
 
 		 110 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  56.25 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  34.09 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  31.11 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  30.23 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.23 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 212 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  34.83 
 
 		 111 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 125 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  36.54 
 
 		 69 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  36.54 
 
 		 69 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>