57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2364 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  216  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  41.9 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  39.05 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  41.77 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  34.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0227  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 114 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.71 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  32.14 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  40.82 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>