24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1982 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  227  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  44.21 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  52 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  35.62 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>