41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04066 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  166  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  51.25 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  49.4 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  46.99 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  49.37 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  50.75 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  51.56 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  42.17 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  44.29 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  39.51 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  38.27 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 258 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  43.86 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  38.24 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  38.96 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  47.62 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  44.23 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>