34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3064 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  80.25 
 
 		 99 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  79.75 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  53.57 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  79.01 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  48.19 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  47.22 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  41.46 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  39.74 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  45.12 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  38.57 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  41.25 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  44.9 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>