41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2959 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  41.9 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  47.31 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  44.83 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  47.17 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  38.38 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  41.94 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  43.75 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  39.58 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  37.31 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>