44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0476 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  91.82 
 
 		 110 aa  203  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  69.72 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  72.55 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  66.36 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  61.39 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  63.77 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  49.43 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  44.33 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  42.39 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  41.18 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  40.62 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  44.78 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  43.42 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  48.19 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 95 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  42.47 
 
 		 84 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  43.08 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 276 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  28.87 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>