26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5011 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  46.3 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  28.99 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.14 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  34.92 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  29.03 
 
 		 116 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>