37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2925 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  72.64 
 
 		 114 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  74 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  74 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  69.74 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  47.47 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  31.82 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  31.25 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  41.82 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  31.34 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  29.79 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0029  helix-turn-helix domain-containing protein  55.26 
 
 		 855 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.14 
 
 		 264 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0035  XRE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 853 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  32.14 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  39.71 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>