75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2290 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  93.24 
 
 		 75 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  30.99 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.21 
 
 		 508 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 516 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 206 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 87 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.71 
 
 		 517 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 174 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 75 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  31.58 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  28.57 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 528 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  36.84 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.71 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 202 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  29.82 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0032  hypothetical protein  30.65 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.31376e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.82 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  29.82 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0351  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 111 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.598178  normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.82 
 
 		 94 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.82 
 
 		 94 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 205 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>