59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1840 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  219  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  81.98 
 
 		 111 aa  156  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  71.29 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  63.96 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  68.37 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  69.23 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  47.31 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  48.94 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  45.88 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  48.19 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  40.38 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  44.16 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  40.51 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  39.56 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  45.21 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  35.64 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 258 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  34.55 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 200 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 120 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>