31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0283 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  92.5 
 
 		 99 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  93.41 
 
 		 109 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  79.75 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  60.71 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  51.56 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  52.24 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  47.3 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  47.06 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  42.68 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  47.56 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  42.42 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  56.41 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  40.32 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  37.31 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>