55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3689 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  71.59 
 
 
99 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  53.57 
 
 
116 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  60.71 
 
 
91 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  73.42 
 
 
109 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  46.53 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  49.4 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  43.96 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  45.36 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  43.96 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  51.72 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  41.76 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
216 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  37.33 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  38.83 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  39.56 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  39.19 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  37.35 
 
 
121 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  33.94 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 
258 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  38.6 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
210 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  41.18 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  32.5 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  35.94 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0688  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  34.62 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
351 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.211788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>