58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0236 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  81.98 
 
 		 111 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  64.86 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  69.39 
 
 		 111 aa  127  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  64.29 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  59.74 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  47.17 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  45.88 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3064  hypothetical protein  45.12 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  42.27 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0283  hypothetical protein  47.56 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768179  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  44.44 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  40.2 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  42.35 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  41.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  41.49 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  42.05 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0262  transcriptional regulator, XRE family  46.91 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  43.21 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  43.84 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2230  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1975  XRE family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2040  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  38.64 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 276 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  38.57 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  37.33 
 
 		 652 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>