18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0895 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  39.56 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  36.21 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  37.66 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  32.47 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  27.14 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 276 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  39.66 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  27.45 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  48.78 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>