71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1136 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  100 
 
 		 101 aa  206  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.47 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3752  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4330  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4036  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3589  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  normal  0.395198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2434  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2386  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.52583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2341  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2544  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581927  normal  0.0799833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2430  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.57477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2665  DNA-binding protein  35.58 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.292881  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2600  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0339  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2265  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4226  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2427  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2668  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0997  transcriptional regulator, putative  33.73 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.729204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2941  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0613  putative transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000041852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1240  helix-turn-helix domain protein  35.37 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4161  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1338  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0866  Xre family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  41.51 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0895  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  42.59 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0160  helix-turn-helix domain protein  34.04 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  42.59 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  42.59 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  43.14 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2159  hypothetical protein  32.58 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 217 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  36.62 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  36.62 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  37.74 
 
 		 270 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  34.18 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 182 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  39.29 
 
 		 154 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>