24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0785 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0054  hypothetical protein  44.62 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000131489  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1634  hypothetical protein  47.69 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0918  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00833236  normal  0.201916 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  51.2  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0805  hypothetical protein  40.32 
 
 		 84 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  38.64 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0865  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  36.92 
 
 		 101 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  26.92 
 
 		 477 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 100 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 112 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 110 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 		 112 aa  40.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>