More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1417 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
477 aa  959    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1238  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.97 
 
 
288 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.792521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  48.1 
 
 
163 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  47.8 
 
 
171 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  46.15 
 
 
170 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  45.28 
 
 
169 aa  143  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3010  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.53 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3880  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.02 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  47.44 
 
 
170 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  46.15 
 
 
170 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  47.44 
 
 
173 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  48.05 
 
 
163 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  47.4 
 
 
163 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  47.17 
 
 
162 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  46.71 
 
 
171 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3407  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.76 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  46.25 
 
 
177 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  48.43 
 
 
162 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.2 
 
 
166 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  44.87 
 
 
167 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1248  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.56 
 
 
368 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450925  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  44.03 
 
 
162 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  45.91 
 
 
172 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  43.67 
 
 
161 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2103  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 
372 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  46.1 
 
 
171 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.19 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  46.75 
 
 
168 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  44.94 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1603  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.92 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0977519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1314  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.56 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  47.06 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  42.48 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  42.86 
 
 
172 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  42.95 
 
 
176 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1663  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.46 
 
 
377 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655782  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  42.31 
 
 
167 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.84 
 
 
412 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.880614  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1375  putative racemase transmembrane protein  33.33 
 
 
368 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0625806  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  41.88 
 
 
163 aa  123  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4191  hypothetical protein  32.87 
 
 
393 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1356  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.22 
 
 
362 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0359524  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  42.77 
 
 
164 aa  121  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49070  hypothetical protein  31.87 
 
 
393 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2474  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.84 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000208733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1554  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.35 
 
 
382 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2390  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.69 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104419  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2107  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.14 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5761  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.46 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4258  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.32 
 
 
351 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  41.67 
 
 
164 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  29.41 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  42.14 
 
 
165 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3809  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.06 
 
 
348 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320712  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  40.25 
 
 
173 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  41.77 
 
 
174 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.57 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659137  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0831  putative acyl-CoA transferase  29.15 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150228  normal  0.0178347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  41.03 
 
 
164 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.72 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4307  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.74 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3823  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.06 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3441  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.11 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.462369  normal  0.0726285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3897  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.06 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.47708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4235  Alpha-methylacyl-CoA racemase  30.55 
 
 
393 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3480  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.87 
 
 
406 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2483  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.88 
 
 
381 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3358  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.85 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2722  putative alpha-methylacyl-CoA racemase  31.75 
 
 
389 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2969  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.49 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0453018  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  27.39 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0309  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.74 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  40.88 
 
 
164 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3888  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.97 
 
 
380 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307047  normal  0.400456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1527  Alpha-methylacyl-CoA racemase  30.51 
 
 
391 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351028  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  37.74 
 
 
175 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4099  acyl-CoA transferase/L-carnitine dehydratase CaiB  30.28 
 
 
411 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0342589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  38.85 
 
 
173 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  38.99 
 
 
160 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1622  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.46 
 
 
391 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 
175 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2597  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.87 
 
 
367 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5306  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.65 
 
 
365 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0561712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  37.74 
 
 
168 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2342  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.08 
 
 
391 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1184  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.34 
 
 
356 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2957  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.26 
 
 
364 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  37.11 
 
 
175 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  36.2 
 
 
169 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.81 
 
 
395 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5357  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  25.49 
 
 
464 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203757  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  43.67 
 
 
168 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  43.67 
 
 
168 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4167  Alpha-methylacyl-CoA racemase  30.27 
 
 
387 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  36.71 
 
 
176 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.97 
 
 
390 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  43.67 
 
 
168 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  43.67 
 
 
168 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>