15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03330 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 100 aa  202  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0521  DNA-binding protein  40.66 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  37.29 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  34.33 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  31.11 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  32.86 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 126 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 133 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>