43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0291 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  39.73 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  41.94 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  42.19 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  43.08 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  40.68 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  33.85 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  38 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 75 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>