16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1856 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  43.06 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  34.48 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1443  hypothetical protein  47.5 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  47.06 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  38 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  51.61 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>