35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2952 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  67.53 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  50.65 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  50.65 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  50 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  50.65 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  48.05 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  45.45 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  46.75 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  42.86 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03914  SpoVT/AbrB-like protein  52.46 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  41.43 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  46.97 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  46.97 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  38.96 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.19 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  39.19 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  43.84 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.71 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  38.96 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  44.62 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  43.94 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  32.47 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.47 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  37.8 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  35.38 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  43.75 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.47 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  33.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>