31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3681 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  100 
 
 
76 aa  154  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  88.16 
 
 
76 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  72.37 
 
 
76 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  69.74 
 
 
76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  68.42 
 
 
76 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  71.62 
 
 
75 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  66.67 
 
 
75 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  69.74 
 
 
76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  64.86 
 
 
76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  64.86 
 
 
76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  51.32 
 
 
76 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  53.42 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  53.33 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  47.3 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  50 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  50.65 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  44.16 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  48.68 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  48.44 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  38.96 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  37.18 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.14 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  36.11 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  31.82 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  32.47 
 
 
75 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  35.06 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>