64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1867 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 75 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  90.67 
 
 		 75 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  57.33 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  50.67 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  53.33 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  49.33 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  46.67 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  47.62 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  50.68 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  46.05 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  50.88 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  50 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  55.77 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  42.11 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  49.23 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  37.66 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  41.03 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  45.9 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  45.9 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  38.67 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  41.56 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  60.98 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  41.94 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  34.62 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  48.08 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  37.66 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  37.66 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  38.96 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  40.26 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  40.26 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  35.06 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.46 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  35.94 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.92 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.28 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  38.96 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  40 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  36.92 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  41.51 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  51.22 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  37.04 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  36.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  39.24 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  35.06 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  35.06 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  34.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  37.18 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  32.47 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  36 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  38.96 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  37.14 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  40 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  48.94 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.67 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.78 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  38.1 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  33.96 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>