34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4623 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  100 
 
 
76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  71.05 
 
 
76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  71.05 
 
 
76 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  72.97 
 
 
75 aa  116  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  70.27 
 
 
75 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  69.74 
 
 
76 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  69.74 
 
 
76 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  68.42 
 
 
76 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  68.92 
 
 
76 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  68.92 
 
 
76 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  54.67 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  52.63 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  52.63 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  67.92 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  48.65 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  48.05 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  55.38 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  48.05 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  50.65 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  41.33 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  46.77 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  37.5 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.66 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  37.33 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  40.91 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  37.66 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.06 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  38.46 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.92 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  34.21 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  39.19 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.92 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  29.87 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>