22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2633 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  70.97 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  44.78 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  52.31 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  43.04 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  48.44 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  51.85 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  42.42 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  46.77 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  49.09 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  40.32 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  40.32 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  50.94 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  45.16 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  34.29 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  41.82 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  44.23 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  33.85 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  35.19 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>