25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0153 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  100 
 
 		 76 aa  153  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  59.21 
 
 		 76 aa  90.5  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  57.53 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  52.63 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  54.79 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  50 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  48.68 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  48 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  46.67 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  43.24 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  43.24 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  49.33 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  42.86 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  44.59 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  47.69 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  38.96 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  49.33 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  38.16 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  43.4 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  41.82 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  36.36 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  31.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  34.21 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>