47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0140 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  100 
 
 		 76 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  78.95 
 
 		 76 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  64.47 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  64.47 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  64.47 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.69 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  47.69 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  45.31 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  40.62 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  37.5 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  40.62 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  44.62 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  44.62 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  43.94 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  41.54 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  38.89 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  41.18 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  34.33 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.83 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.83 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.88 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  40.35 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  33.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  40.3 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  31.94 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  40.91 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  38.46 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  38.46 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.5 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  31.94 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  32.35 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  31.82 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  51.16 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  29.58 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  34.33 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  30.77 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  34.33 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  31.51 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  43.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  28.79 
 
 		 76 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  49.02 
 
 		 64 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>